北京土壤学会成立于1957年7月，由李连捷、彭克明、张乃凤、朱莲青等先生发起。

历届理事长为：李连捷（第一二、三、四届）、毛达如（第五、六届）、黄鸿翔（第七、八届）、李保国（第九、十届）、徐明岗（第十一、十二届）。

现系第十四届理事会，理事长：黄元仿，常务副理事长：邹国元，秘书长：刘宝存。

设置四个专业委员会：土壤健康与保育、植物营养与施肥、污染控制与修复、分析测试，四个工作委员会：土壤工程与企业发展、团标与评价、科普、青年。